Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms