Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SUSD3Q96L08 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD3Q96L08 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms