Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms