Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NXNL1Q96CM4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NXNL1Q96CM4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms