Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYTL4Q96C24 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYTL4Q96C24 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms