Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TAF4BQ92750 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms