Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM29Q86T20 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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