Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms