Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP54Q7Z3B4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms