Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CATSPER4Q7RTX7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms