Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HECW1Q76N89 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms