Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XIRP1Q702N8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms