Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC36A4Q6YBV0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC36A4Q6YBV0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms