Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms