Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms