Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM208BQ5VWN6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms