Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C9orf135Q5VTT2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf135Q5VTT2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms