Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PXDC1Q5TGL8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PXDC1Q5TGL8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PXDC1Q5TGL8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PXDC1Q5TGL8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PXDC1Q5TGL8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PXDC1Q5TGL8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PXDC1Q5TGL8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PXDC1Q5TGL8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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