Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FRMPD1Q5SYB0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms