Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RNF212Q495C1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RNF212Q495C1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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