Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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KRTAP21-3Q3LHN1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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