Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms