Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC96Q2M329 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms