Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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