Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTN1Q16799 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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