Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LAMA3Q16787 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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