Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms