Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC37Q16543 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms