Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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