Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms