Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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EFNB3Q15768 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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EFNB3Q15768 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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EFNB3Q15768 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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EFNB3Q15768 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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EFNB3Q15768 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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EFNB3Q15768 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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