Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERC3Q15034 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERC3Q15034 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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