Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCLAFQ15004 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms