Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COL4A6Q14031 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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