Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DDX39BQ13838 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms