Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGA9Q13797 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA9Q13797 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms