Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHROOM2Q13796 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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SHROOM2Q13796 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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