Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNA1SQ13698 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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