Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD1Q13562 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms