Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TUBB3Q13509 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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