Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms