Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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