Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TROQ12816 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TROQ12816 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TROQ12816 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TROQ12816 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TROQ12816 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TROQ12816 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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