Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGNL1Q0VF96 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms