Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms