Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP6Q0PNE2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms