Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms