Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SOX4Q06945 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms