Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CALD1Q05682 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms