Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIN1Q05586 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms